Об удивительных способностях Бомелия-лекаря весьма красноречиво свидетельствовал факт чудесного воскрешения им придворного шута Осипа Гвоздева. Как-то во время разгульной трапезы Гвоздев допустил шутку, которая вызвала недовольство Иоанна Грозного. Недолго думая, разгневанный царь вылил на шута миску горячих щей, а когда тот кинулся прочь, нанес несчастному удар ножом. Гвоздев, истекаю кровью, рухнул на пол и забился в предсмертных судорогах. К умирающему шуту подбежал Бомелий, наложил руку на рану и дал ему испить некоего снадобья. Гвоздев немедленно забылся крепким и долгим сном, после которого, как утверждали после придворные царя, быстро пошел на поправку.
Благодаря своим тайным знаниям Бомелий сумел быстро нажить немалое состояние и весьма дурную славу, которая гремела не только по Москве, но и в ее окрестностях. И тем не менее однажды случилось то, о чем древние говорили: «Принесший черную весть должен умереть».
В один из поздних вечеров, играя с Бомелием в шахматы, Иоанн Грозный спросил звездочета о том, что же ждет его и весь его род. Как описывают историки, Елисей подошел к магическому хрустальному шару, обнял его руками и закрыл глаза. Вдруг лицо его исказила гримаса ужаса. Когда же Бомелий открыл глаза, то, потрясенный увиденным, сообщил царю о том, что старший сын его примет смерть от руки царской, средний безвременно умрет, а младший заколется в припадке неизлечимой болезни. Держава же Иоаннова будет лежать во прахе.
Разгневавшись на слова Елисея, царь ударил неосмотрительного прорицателя по голове серебряным кубком. Три дня Бомелий лежал без памяти между жизнью и смертью, однако врачам Иоанна IV удалось излечить раненого звездочета.
Оправившись от раны, нанесенной царем, Бомелий стал задумываться о своем пошатнувшемся положении при дворе. Вскоре он вступил в сговор с ненавистными Иоанну Грозному псковскими боярами. В одну из ночей, прихватив нажитое золото, Елисей бежит из Москвы. Но уже через сутки на пути к Пскову Бомелий был схвачен и в цепях привезен в Первопрестольную.
После жестоких пыток, во время которых звездочет выдал всех своих сообщников, Бомелий подвергся мученической казни. По воспоминаниям современников опального мага вздернули на дыбе, вывернули все суставы, вывихнули ноги пятками вперед, а затем заживо сожгли.
Так печально закатилась звезда удачливого авантюриста и загадочной личности, оказавшейся волею судеб в XVI веке в России.