В первые дни Великой Отечественной войны в Екатерининском дворце началась эвакуация музейных ценностей. Из-за хрупкости янтарных панелей их не демонтировали, а закрыли слоями бумаги, марли и ваты, а затем замаскировали деревянными щитами. Но это не помогло. Когда в Пушкин ворвались немцы, все янтарные панно, состоящие из 143 предметов были сняты и вывезены в 22 ящиках в музей Кенигсберга. В 1944 году, при отступлении немцев, во время мощнейших налетов 29 августа и 2 сентября центр Кенигсберга был разрушен, а замок частично сгорел, превратившись в развалины. Янтарный кабинет был спасен в его глубоких подвалах, о чем искусствовед Роде доложил в Берлин. Панели снова были разобраны, упакованы в ящики и вывезены в неизвестном направлении. С этого момента следы Янтарной комнаты теряются. Безусловно, Янтарный кабинет, также, как всемирно известная библиотека Ивана Грозного привлекают к себе огромное внимание, ведь на протяжении уже нескольких десятилетий оригиналы все еще не найдены.