Для того, чтобы следить за изменениями файлов, можно воспользоваться контрольной суммой. Для этого необходимо установить 7Zip либо любое подобное приложение, позволяющее это сделать.
С помощью питона можно реализовать базу данных. Которая будет записывать в какую-то базу данных контрольные суммы. И при изменении файла, можно определить используется актуальный файл или измененный...