​​​​​​​​Леонардо, Рафаэль, Микеланджело, Донателло и Сплинтер — это все имена четырех черепашек и крысы, которые являются подопытными в эксперименте одного ученого. Он создает особый мутаген, который способен изменить живых существ до неузнаваемости. Конечно же, он человек добрый и верит, что его исследования, способны изменить мир к лучшему. Вот только руководство, что стоит в тени, думает иначе. Злобный клан Фут, под управлением могущественного злодея Шредера, при помощи этого средства, планирует захватить город...

Первый сезон выпущен в эфир в декабре 1987 года. Первый сезон состоит из пяти эпизодов, которые стали пилотными. Во всех эпизодах первого сезона Технодром располагается под Нью-Йорком. Краткий список серий: 1. По следам черепашек Нью-Йорк переживает волну преступности. Репортер Эйприл О'Нил обнаруживает воров являющихся ниндзя. Уличная банда нападает на Эйприл, она сбегает в канализацию, где её спасают черепашки. От их вида она падает в обморок, и черепахам не остается ничего другого, как отнести её к себе на базу...