33,4K подписчиков
Ученые из Медицинского колледжа Бэйлора и других стран говорят, что обнаружили субфоссилии древних хромосом в останках самки шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius), которая жила 52 000 лет назад в древней Сибири.
Сохранившиеся останки сохранили структуру древних хромосом вплоть до нанометрового масштаба — миллиардных долей метра. Исследователи выдвигают гипотезу, что кожа мамонта самопроизвольно сублимировалась на сибирских холодах, что позволило окаменелостям хорошо сохраниться.
Знание трехмерной структуры генома предоставляет много дополнительной информации помимо его последовательности, но большинство древних образцов ДНК состоят из очень маленьких, скремблированных фрагментов ДНК.
Основываясь на работе по составлению трехмерной структуры генома человека, доктор Эйден и его коллеги подумали, что если удастся найти правильный образец древней ДНК, то можно будет использовать те же стратегии для сборки древних геномов.
В течение пяти лет они тестировали десятки образцов, прежде чем наткнулись на необычайно хорошо сохранившегося шерстистого мамонта, который был раскопан недалеко от Белой Горы, что в Якутии, в сентябре 2018 года.
Чтобы реконструировать архитектуру генома мамонта, авторы извлекли ДНК из образца кожи, взятого за ухом мамонта.
Они использовали метод под названием Hi-C, который позволяет им определять, какие участки ДНК, вероятно, находятся в непосредственной пространственной близости и взаимодействуют друг с другом в их естественном состоянии в ядре.
“Представьте, что у вас есть головоломка, состоящая из трех миллиардов частей, но у вас нет изображения того, как должна выглядеть головоломка в финале, чтобы с ней можно было работать”, - сказал профессор Марк Марти-Реном, специалист по структурной геномике из Национального центра анатомии и Центра геномной регуляции.
“Hi-C позволяет вам получить приблизительное представление об этой картине, прежде чем вы начнете складывать кусочки головоломки вместе”.
Затем они объединили физическую информацию, полученную в результате анализа Hi-C, с секвенированием ДНК, чтобы идентифицировать взаимодействующие участки ДНК и создать упорядоченную карту генома мамонта, используя геномы современных слонов в качестве шаблона.
Анализ показал, что у шерстистых мамонтов было 28 хромосом — столько же, сколько у современных азиатских и африканских слонов.
“Это новый тип свидетельств древней жизни, и его масштаб превосходит масштаб отдельных фрагментов древней ДНК в миллион раз”, - сказал доктор Эрез Либерман Эйден, директор Центра геномной архитектуры Медицинского колледжа Бэйлора.
14 июля
195 просмотров