Исследователи из Университета Восточной Англии установили, что колоректальный рак обладает специфическим микробным профилем, который отличает его от других видов злокачественных новообразований. Результаты работы, опубликованные в журнале Science Translational Medicine, ставят под сомнение гипотезу о том, что каждый тип опухоли имеет свою уникальную микрофлору. Анализ показал, что только в случае с раком кишечника можно говорить о наличии стабильной и узнаваемой генетической подписи микроорганизмов.
В ходе исследования специалисты проанализировали данные полногеномного секвенирования более 9 тысяч пациентов из базы Genomics England. Всего было изучено 11 735 образцов, представляющих 22 различных типа рака. Ученые разработали программное обеспечение для отделения ДНК человека от генетического материала микробов, содержащихся в тканях опухоли, после чего сопоставили полученные сведения с клиническими данными и результатами лечения.
Статистический анализ подтвердил, что исключительно колоректальный рак демонстрирует отчетливую микробную сигнатуру. Эта особенность позволяет с высокой точностью идентифицировать опухоли кишечника среди других новообразований. Для остальных изученных видов рака исследователи не обнаружили столь выраженных и специфических закономерностей в составе микробиома, которые можно было бы использовать в качестве диагностического маркера.
Помимо основной находки, ученые выявили связь между присутствием определенных микроорганизмов и прогнозом заболевания. В частности, наличие некоторых бактерий в тканях саркомы коррелировало с показателями выживаемости: в одних случаях микробы указывали на неблагоприятный исход, в других – на более высокие шансы на выздоровление. По мнению авторов, эти данные помогут врачам точнее предсказывать ответ на терапию и подбирать индивидуальные схемы лечения.
Применение полногеномного секвенирования также позволило эффективнее обнаруживать вирусы, способствующие развитию рака. Исследователи зафиксировали присутствие вируса папилломы человека в образцах рака ротовой полости с более высокой точностью, чем традиционные диагностические тесты. Также были выявлены редкие патогены, такие как Т–лимфотропный вирус человека первого типа, который может десятилетиями находиться в организме в латентном состоянии, прежде чем спровоцировать болезнь.
Авторы подчеркивают, что интеграция анализа микробиома в стандартную процедуру секвенирования в клиниках не потребует существенных дополнительных затрат. Это делает метод перспективным инструментом точной медицины, позволяющим своевременно обнаруживать скрытые инфекции и учитывать микробиологические особенности опухоли при принятии клинических решений.