Сафин родился 27 января 1980 года в Москве. Его отец Мубин занимал административную должность в спортивном обществе «Спартак», а мать Рауза Исланова была одной из лучших теннисисток 1960–70-х и тренером. С шести лет Марат начал заниматься теннисом под ее руководством. В 1990-м Сафин проходил отбор в элитную американскую школу Ника Боллетьери, но не смог поступить. В возрасте 12 лет Марат уехал в Испанию, а два года спустя был зачислен в академию Панчо Альварина. Профессиональная карьера Сафина началась в 1997-м. В своем втором сезоне на турнире Большого шлема (ТБШ) «Ролан Гаррос» он обыграл легендарного американца Андре Агасси и действующего победителя Густаво Куэртена, получив по итогам года приз лучшему новичку. Сафин является самым молодым победителем турнира ATP среди россиян. В 1999-м он в возрасте 19 лет и 7 месяцев обыграл Грега Руседски и завоевал трофей в Бостоне. Следующий год россиянин закончил в статусе первой ракетки мира, обыграв в финале US Open рекордсмена по числу турн