Кандогарское ханство было создано в 1818 году после ослабление Персии и Дурранийской империи,Пуштуна удалось создать феодальное государство на территории Афганистана и управляла им Пуштунская династия Баракзай.
В 1839-1842 годах находилось под английской зависимостью.В 1855 году ханство было присоеденино к Афганистану.