Построен итальянскими архитекторами при Иване III в 1484-1489 годах.
Благовещенский собор был домовой церковью русских великих князей и царей на протяжении столетий. Настоятель Благовещенского собора традиционно являлся духовником царя. В соборе совершали церемонии семейного характера: крестили царских детей, сочетали браком, отмечали дни именин.