Исследователи обнаружили новые типы вирусоидов, которые заражают бактерии в кишечнике человека.
Ученые обнаружили ранее не встречавшийся класс вирусоподобных объектов, которые скрываются в кишечнике и ротовой полости человека. Эти вирусоиды могут влиять на активность генов в нашем микробиоме, сообщает Science.
Исследователи подтвердили, что у этих вирусоподобных сущностей есть один хозяин — обычная бактерия, обнаруженная во рту, под названием Streptococcus sanguinis. Им еще предстоит подтвердить наличие дополнительных хозяев, но они уже подозревают, что, по крайней мере, часть из них — бактерии.
Вирусоиды — это крошечные петли РНК, генетические родственники ДНК. Ранее ученые обнаружили, что, в первую очередь, они заражают растения, такие как картофель. Вирусоиды отличаются от более крупных вирусов на основе РНК по нескольким параметрам. Во-первых, у них нет защитной оболочки, которую вирусы используют, чтобы удержать генетический материал. Во-вторых, в их РНК нет инструкций по построению белков.
Раньше считалось, что вирусоиды заражают только растения. Однако недавние исследования показали, что они заражают и других хозяев, таких как животные, грибы или бактерии. В новом исследовании исследователи искали возможные вирусоиды среди генов микробов, обитающих в организме человека.
В отчете, опубликованном в базе данных препринтов bioRxiv, ученые рассказали о группе вирусоидов, которые они обнаружили в кишечнике и рту человека, и назвали «Обелиски». Всего они идентифицировали около 29 960 примеров вирусоидов. Работу еще не рецензировали, и не была опубликовали в научном журнале.
Их назвали «Обелисками», потому что вторичная структура вирусоидов — трехмерная форма, которую они принимают, складываясь внутрь, — по прогнозам, будет выглядеть как тонкий стержень.
Используя ранее опубликованные данные, исследователи изучили данные об активности генов в различных микробных сообществах в организме. Эти сводки активности генов известны как метатранскриптомы.
Они обнаружили, что «обелиски» присутствовали примерно в 7% метатранскриптомов человеческих фекалий. Эти образцы стула дали представление об активности генов в микробиоме кишечника. Ученые также обнаружили недавно названные вироиды в 17 из 32, или примерно в 53%, метатранскриптомов рта, которые проверили.
Читать далее:
«Хаббл» показал очень старую галактику: она не похожа на молодой Млечный Путь
Физики озадачены: в нашей галактике происходит «что-то подозрительное»