Вероятно проблема в файле \bitrix\modules\main\bx_root.php
Правильное содержимое файла на текущий момент:
<?php
define("BX_ROOT", "/bitrix");
if(isset($_SERVER["BX_PERSONAL_ROOT"]) && $_SERVER["BX_PERSONAL_ROOT"] <> "")
define("BX_PERSONAL_ROOT", $_SERVER["BX_PERSONAL_ROOT"]);
else
define("BX_PERSONAL_ROOT", BX_ROOT);