1939-1941 годы. Эстония
С первых же дней вхождения Эстонии в состав СССР на территории Эстонской Республики начали работу органы государственной безопасности, созданные, как из опытных сотрудников НКВД, прибывших из Москвы, так и из местных сторонников советской власти.
Ситуация в Эстонии была сложной и сотрудникам госбезопасности пришлось вести большую работу по борьбе с врагами новой Советской Эстонии.
За короткий срок, предшествующий началу Великой Отечественной войны, оперативными группами в Эстонии были вскрыты подпольные антисоветские националистические организации и заговорщические группы, в руководстве которых стояли бывшие вабсовцы, деятели «Кайтселиита» и другие ставленники прежней власти, ликвидировано несколько резидентур немецкой разведки и выявлено значительное количество шпионов других иностранных разведок. В 1940 году сотрудники госбезопасности нашли и арестовали Линхорста — непосредственного участника расстрела большого друга и сторонника СССР Виктора Кингисеппа.
В 1940-1941 годах органы госбезопасности республики выявили повстанческую организацию «Комитет спасения», возникшую в период выборов первого народного правительства (июль 1940 года) и пытавшуюся протащить в состав этого правительства своих кандидатов, чтобы противодействовать установлению Советской власти. Потерпев поражение на выборах, часть активных деятелей комитета перешла на нелегальное положение, установила связь с немецкой и финской разведками и стала вести подготовку к свержению Советской власти. Преследовалась цель объединить Эстонию с Финляндией и создать «великую Финляндию». В результате проведенных сотрудниками ГБ мероприятий было арестовано 119 участников «Комитета спасения», изъято много оружия, боеприпасов и радиопередатчиков.
В ноябре 1940 года был раскрыт военный заговор офицеров 22-го территориального корпуса в Эстонии, готовивших свержение Советской власти и восстановление независимой Эстонской Республики, ориентирующейся на Германский рейх. Заговорщики наладили связь с германской разведкой и намеревались осуществить свои планы в момент нападения фашистской Германии на СССР. Было арестовано 44 участника заговора, изъято оружие.
С чем приходилось сталкиваться и в каких условиях проходила деятельность органов госбезопасности Эстонской советской Республики говорит следующая цифра. Только одна местная подпольная националистическая организация «Омакайтсе», тесно сотрудничавшая с немцами, насчитывала в своих рядах до ста тысяч человек.
Местными органами НКВД также предпринимались мероприятия по выселению из Эстонии наиболее активных сторонников независимой националистической Эстонии, ярых антисоветчиков и членов их семей.
