Сергей Черногубовский окончил Санкт-Петербургский государственный морской технический университет по специальности инженер-кораблестроитель. Его трудовая деятельность началась на Адмиралтейских верфях в 1993 году. За почти 30 лет трудового стажа занимал различные руководящие должности. В структуре госкорпорации «Росатом» — «Концерн Росэнергоатом» возглавлял строительство единственной в мире плавучей атомной электростанции «Академик Ломоносов». В течение 5 лет руководил строительством головного и первых двух серийных универсальных атомных ледоколов проекта 22220 на Балтийском заводе. Работал первым заместителем директора — заместителем директора по производству филиала «Севастопольский морской завод» АО «ЦС «Звездочка».
С 2021 года Сергей Черногубовский возглавляет департамент гражданского судостроения ОСК.
Напомним, 9 января 2023 года стало известно, что совет директоров ПАО «Выборгский судостроительный завод» досрочно прекратил полномочия Александра Соловьева, занимавшего должность генерального директора ВСЗ с июня 2012 года. С 10 января 2023 года временно исполняющим обязанности генерального директора был избран глава ОСК Алексей Рахманов. Как прокомментировали в пресс-службе корпорации, мероприятия, связанные с кадровыми перестановками, инициированы в целях повышения управляемости ключевыми активами группы, что предполагает передачу функций единоличных исполнительных органов в управляющую компанию. Выборгский судостроительный завод — первое общество группы ОСК, с которого началось изменение системы управления. При этом Алексей Рахманов остается в должности генерального директора АО «ОСК» как управляющей компании.
ПАО «Выборгский судостроительный завод» (входит в состав АО «Объединенная судостроительная корпорация») — одно из крупнейших судостроительных предприятий, расположенных в Северо-Западном регионе России. С момента основания (1948 год) завод построил около 250 судов различного назначения, 9 морских буровых платформ и 105 модулей верхних строений платформ для разработки нефтегазовых месторождений. Суммарное водоизмещение построенных судов составляет 1,55 млн тонн.