Название села Непецино связано с фамилией старинного дворянского рода Непейцыных, а та, в свою очередь, была образована после отказа одного из ее представителей пить на пиру у крымского хана. Село Непецино в Коломенском уезде было образовано примерно в 70-е годы XVI столетия. Сегодня Непецино – крупное подмосковное село с населением около двух с половиной тысяч человек. Оно является центром сельского поселения и стоит на берегу реки Северки.
Нынешнее здание сельской церкви в честь иконы Божьей Матери «Знамение» было построено в начале XIX века, когда имением Непецино владел Александр Новиков, родственник русского просветителя Николая Новикова. В строительстве также приняли участие помещики Ключаревы. Храм стоял, окруженный живописным парком, рядом с ним находилось кладбище, на котором находили последний приют Новиковы и служители храма. Второй престол храма был освящен в честь Георгия Победоносца. Здание было выстроено в стилистике зрелого классицизма, его автором мог быть один из представителей казаковской школы. Верхнюю часть здания украсила купольная ротонда, на фасаде автор разместил портик с колоннами ионического ордера, над входом в церковь построил колокольню в три яруса, снесенную при большевиках.
После установления Советов непецинский храм был национализирован в 20-е годы: ценности были изъяты в пользу голодающих, а само здание после внутренней перепланировки стало местным домом быта – в нем располагались ателье, парикмахерская, столовая, магазин и контора. К зданию была прилеплена пристройка, в которой устроили клуб, а кладбище было варварски превращено в танцевальную площадку. Возвращение здания РПЦ состоялось в 1992 году, а освящение восстановленного храма – в 2001-м.