Сезон 1 (2005—2006)
Это история о двух братьях. Старший — Линкольн Барроуз, парень неблагополучный, находится под стражей в тюрьме строгого режима «Фокс Ривер» в ожидании смертной казни за убийство брата вице-президента, которое он не совершал. Его брат Майкл Скофилд решает спасти своего брата и устроить побег из тюрьмы. Для реализации плана Майкл устраивает фальшивое ограбление банка, отказывается от услуг адвоката и сам садится в ту же тюрьму, где ждёт казни его брат. В своё время он работал в фирме, которая занималась реконструкцией объекта «Фокс Ривер» и знает немало интересных особенностей всех помещений. Вся необходимая информация всегда находится при Майкле, поскольку перед отправкой на тюремные нары он сделал себе впечатляющую татуировку на теле .
В то время, как Майкл работает над выполнением плана в тюрьме, знакомясь с местными авторитетами и готовя побег века, подруга детства братьев — адвокат Вероника Донован занимается собственным расследованием убийства брата вице-президента. Она пытается выяснить, кто же подставил Линкольна и кто стоит за чередой убийств, связанных с этим делом.
Сезон 2 (2006—2007)
Второй сезон начинается с побега восьми заключённых из тюрьмы «Фокс Ривер». После побега беглецы разделяются для реализации своих планов. Брэда Беллика (Уэйд Уильямс) увольняют из тюрьмы, где он работал главным надзирателем, после чего он решает подключиться к розыскам беглецов за обещанное за их поимку вознаграждение. Федеральный агент Александр Махоун (Уильям Фихтнер) возглавляет группу поимки беглецов, но впоследствии выясняется, что его завербовала «компания» для уничтожения всех сбежавших из тюрьмы. Агент секретной службы Пол Келлерман (Пол Адельштейн) работавший на «компанию» отстранён от дел, и решает в отместку присоединиться к сбежавшим братьям. Позднее он реабилитирует Сару Танкреди и Линкольна Барроуза. Братья смогли уплыть в Панаму, куда за ними отправился Махоун и Беллик. Майкл подставляет Махоуна, но и сам попадается в руки Панамской полиции, после чего его самого, Махоуна, Беллика и Багвела сажают в местную тюрьму именуемую — «Сона».
Сезон 3 (2007—2008)
Премьера третьего сезона сериала состоялась 17 сентября 2007 года. Первые 17 минут премьерной серии были показаны на официальном сайте сериала 24 августа 2007 года. Изначально сезон должен был состоять из 22 серий, но из-за зимней забастовки сценаристов, продлившейся 100 дней, было снято лишь 13 серий. Сюжет продолжает финал второго сезона в Панаме. Хотя Линкольна оправдали, Майкл был заключён в федеральную тюрьму «Сона» лицом к лицу с убийцами. Махоуна, Багвелла и Беллика также заключили в Сону за различные преступления. «Компания» взяла в заложники Сару и Линкольна-младшего и отпустит их, если Линкольн и Майкл помогут бежать заключённому.
Люди, которые захватили в плен подругу Скофилда Сару Танкреди, подстраивают её убийство и угрожают убить сына Линкольна Эл-Джея. Братьям необходимо выполнить условия правительственных вымогателей и вывести из «Соны» загадочную личность — Джеймса Уистлера.
Сезон 4 (2008—2009)
Премьера 4 сезона состоялась 1 сентября 2008 года[7]. Как и обещали продюсеры, Сара Танкреди, которая, как полагали, была убита в третьем сезоне, вернулась в сериал[8]. В новом сезоне также появились новые герои, в их числе агент департамента внутренней безопасности США Дон Селф (Майкл Рапапорт), объединившийся с Майклом и Линкольном в борьбе против «Компании», который пообещал, что даст им свободу в обмен на «Сциллу».
Сезон 5 (2017)
Премьера пятого сезона состоялась 4 апреля 2017 года. Большинство актерской группы вернулось в сериал после длительного перерыва. Действие происходит в Йеменской тюрьме Огигия, где Майкл отбывает наказание под псевдонимом Каниэль Аутис.
