Первый сезон выпущен в эфир в декабре 1987 года. Первый сезон состоит из пяти эпизодов, которые стали пилотными. Во всех эпизодах первого сезона Технодром располагается под Нью-Йорком.
Краткий список серий:
1. По следам черепашек
Нью-Йорк переживает волну преступности. Репортер Эйприл О'Нил обнаруживает воров являющихся ниндзя. Уличная банда нападает на Эйприл, она сбегает в канализацию, где её спасают черепашки. От их вида она падает в обморок, и черепахам не остается ничего другого, как отнести её к себе на базу. Там Эйприл встречает их наставника, крысу Сплинтера, который рассказывает ей свою предысторию о японском ниндзя Хамато Йоши. Черепашки и Эйприл расследуют улицы воровского происхождения, они обнаруживают группу роботов-ниндзя, по признанию Сплинтера униформа принадлежащие клану фут. Эйприл может их разоблачить, она похищена Шреддером. Черепашки отправляются в погоню, чтобы освободить её.
2. Внимание: Шреддер!
Лидер клана Фут Ороку Саки (Шреддер) решает вместе со своим партнером Крэнгом из Измерения Икс превратить двух головорезов в мутантов, используя мутаген, который создал Сплинтер. Таким образом Бибоп и Рокстеди превращается в кабана и носорога. При попытке проникнуть внутрь Технодрома его охранные системы захватывают Сплинтера, и черепашки идут его спасать в Технодром.
3. Кое-что о крысах
Шреддер нанимает учёного Бакстера Стокмана, потому что его изобретение крысы-роботы, охотники за мышами может помочь ему найти Сплинтера. После первоначальной атаки охотников за мышами, черепахи и Сплинтер идут прятаться в квартире Эйприл.
4. Крутые тинейджеры из измерения «Икс»
Шреддер впервые открывает портал в Измерение Икс, откуда появляется компания Нейтрино и двое каменных солдат Крэнга, с которыми сразу завязывают бой Бибоп и Рокстеди. Шреддер останавливает бой и Трааг с напарником на танке отправляются ловить Нейтрино, которые уже познакомились с черепашками. Те вступают в бой используя свою технику, и Леонардо удается вывести из строя танк Траага, но тем временем на место схватки прибывает полиция и солдаты. Трааг и его напарник отступают, прежде чем добраться до Технодрома, они запускают синтезатор погоды — устройство меняющее погоду в зависимости от его настройки, с которым теперь предстоит разбираться черепашкам.
5. Расщепление Шреддера
Шреддер передаёт сообщение черепахам, демонстрируя генератор обратной мутации, который может превратить Сплинтера обратно в человека. Сплинтер отправляется за ним, а тем временем Шреддер помещает Крэнга в созданное для него тело. Черепахи приходят на помощь Сплинтеру и вступают в сражение с Крэнгом. Затем черепахи побеждают Крэнга и Сплинтер разрушает генератор обратной мутации, чтобы спасти черепах. Шреддер и Крэнг пытаются открыть портал вновь, но Донателло меняет полярность и весь Технодром втягивает в Измерение Икс.
Всем хорошего дня и удачного просмотра!