В этом сезоне мир Человека-Паука расширяется за счёт гармоничного включения в него магии, которая в отдельных случаях неплохо ладит с наукой. Несмотря на название, отцовским грехам посвящены были не все серии. Действительно, в части из них мы узнаём о прошлом некоторых ключевых персонажей, о роли семьи в их жизни. Но весь сезон объединяет мадам Паутина[en] — загадочная провидица, появившаяся в жизни Человека-Паука. Она обладает невероятными мистическими возможностями — такими, как телепатия, контроль над пространством. Она с лёгкостью спасает ему жизнь несколько раз, иногда просто перемещая его в пространстве, но чаще всего давая ему полезные советы, которые он, увы, понимает не сразу. По её словам, она готовит Питера к некой великой битве, самой важной в его жизни. Как потом оказывается, Человеку-Пауку предстоит сразиться с симбиотами Потрошителем (Карнажем) и Смертоносцем (Веномом). Также в этом сезоне появляются новые союзники — Доктор Стрэндж, Вонг, Сорвиголова, Железный человек и Воитель.
Краткий список серий:
28. Доктор Стрэндж
Секта, поклоняющаяся демону Дормамму, похищает Мэри-Джейн Уотсон. Человек-Паук и его новый друг, Доктор Стрэндж, сходятся в бою против отступника по имени Моро.
29. Загадай желание
Доктор Осьминог, взбешённый очередной «кражей» своего изобретения фондом Харди, начинает очередной бой с Пауком. Человек-Паук встречает девочку по имени Таина и рассказывает ей свою историю.
30. Атака Окторобота
Октавиус промыл мозги Человеку-Пауку, и только Таина помогает ему вспомнить, кто он такой.
31. Те же и Зелёный Гоблин
Неудачный эксперимент Нормана Озборна с новым химическим оружием приводит к тому, что Озборн превращается в злодея по имени Зелёный Гоблин. Озборн хочет отомстить правлению корпорации Oscorp, которая ранее выгнала его из своего правления.
32. Неуловимый скейтбордист
Роберт Фаррелл, пытаясь помочь бедной матери, крадёт технологии главаря банды Джексона Уила, соединяет их со своими разработками и становится Неуловимым Скейтбордистом.
33. Подстава
Питер Паркер устроился работать в корпорацию Уилсона Фиска, однако был подставлен его сыном и попал в тюрьму за продажу секретной информации. Слепой адвокат Мэтт Мёрдок, также известный как Сорвиголова, берётся за его дело.
34. Без страха и упрёка
Пытаясь найти улики, снимающие вину с Паркера, Человек-Паук и Сорвиголова врываются в убежище Амбала и ищут диск со следами слива информации. Амбал же пытается сделать всё, чтобы диск с информацией и Паркер остались у него.
35. Идеальный убийца
Алистер Смайт проходит насильную трансформацию под воздействием Амбала и обретает способность ходить, однако под давлением Человека-Паука оборачивает оружие против Фиска.
36. Могильщик
Друг Паркера Робби Робинсон не может уследить за сыном Рэнди, которого пытается завлечь в банду Тумбстоун — Лонни Томпсон Линкольн, когда-то друживший с Робби
37. Возвращение Смертоносца
Дормаму возвращает Симбиота в наш мир: Эдди Брок получает свой шанс отомстить Пауку и снова становится Смертоносцем, а маньяк Клетус Кэссиди — Потрошителем, «потомком» Венома. На стороне Человека-Паука — Воитель.
38. Потрошитель
Потрошитель забирает души для Мондо и слился с симбиотом, но Эдди борется со своим симбиотом и пытается остановить Кэссиди. Ему может помочь доктор Эшли Кафка, которой он рассказывал о своём союзе с Веномом.
39. Пятно
Доктор Джонатан Онн, который когда-то работал на Тони Старка, с помощью временного акселератора случайно насоздавал кротовые норы и стал злодеем по имени Пятно.
40. Гоблин объявляет войну!
Мечтающий отомстить за унижение Домовой (он же Хобгоблин) выходит на арену и борется против Зелёного Гоблина (он же Норман Озборн), а оба бросаются энергией акселератора куда попало.
41. Поворотный момент
Зелёный Гоблин узнаёт тайну Питера Паркера и атакует самых дорогих ему людей. Битва приобретает непредсказуемый характер. Пропадает Мэри Джейн Уотсон.
В этом сезоне:
-Одной из главных новостей этого сезона. Появляется до этого сезона не известный Карнаж, союзник Венома (чёрной Смерти) и враг Человека-паука . Эта парочка останется на очень долгове время вместе. Даже побывает в космосе в одном из сезонов!