Памир — высочайший горный узел не только Таджикистана, но и всего Советского Союза.
В Таджикистане — крае заоблачных высот, бурных рек, плодородных долин, вечных льдов и горячих источников смыкаются крупные горные системы Земли — Памир и Тянь-Шань. Около 93% территории Таджикской ССР (общая площадь 143 тыс. км2) занято горами. Абсолютные высоты земной поверхности колеблются от 300 до 7495 м. Почти половина территории республики расположена на высоте более 3 тыс. м. Природа Таджикистана отличается разнообразием, резкими контрастами и наличием уникальных ландшафтов. Здесь соседствуют субтропическая жара межгорных долин и арктический холод высокогорных плато. Горы Таджикистана поражают взор величием, суровостью и разнообразием очертаний. Они тянутся на сотни километров, сохраняя преимущественно широтное направление.
На Памире сходятся грандиозные горные цепи Центральной Азии — Каракорум, Куэнь-Лунь, Гиндукуш. Недаром его называют «Крышей мира» или «Краем у подножия солнца». Ядром Памирской горной системы является хребет Академии наук с наивысшей точкой нашей страны — пиком Коммунизма (7495 м). Здесь на высоте 6000—6100 м лежит так называемое Памирское ледяное плато с толщиной льда до 150 м, а также крупнейший в Советском Союзе горно-долинный ледник Федченко. По своим физико-географическим условиям различаются Восточный и Западный Памир. Условную границу между ними проводят по линии, соединяющей ледник Федченко с пиком Карла Маркса в Шахдаринском хребте.
Восточный Памир — высокое нагорье с широкими долинами и суровым пустынным климатом. Днища долин и котловин расположены на высоте 3600—4000 м. Горные хребты Восточного Памира— Сарыкольский, Музкольский и др., несмотря на большую высоту (до 6 тыс. м над уровнем моря), отличаются сравнительно малой изрезанностью и плавностью очертаний, свойственных среднегорному рельефу.
На Западном Памире (Бадахшан), кроме пограничного с Восточным Памиром хребта Академии наук, находятся Дарвазский, Ванчский, Язгулемский, Рушанский, Шугнанский, Шахдаринский и Ишкашимский хребты. Эти узкие горные гряды с острыми зазубренными гребнями отделены друг от друга глубокими долинами, прорезанными бурными реками. Водоразделы хребтов несут покров вечных снегов. Долины на Западном Памире находятся на высоте 1700—2500 м, а горные хребты возвышаются над ними на 1500—3500 м.
Северо-западнее Памира находятся величественные хребты Петра Первого и Дарваза.
Гиссаро-Алайскую горную систему располагающуюся в Центральном Таджикистане между Ферганской долиной на севере и Гиссарской долиной и Сурхоб на юге, нередко называют Кухистан, или Страна гор. Эти системы гор образуют западную часть Южного Тянь-Шаня. Здесь широтно вытягиваются Туркестанский, Зеравшанский, Гиссарский и Каратегинский хребты. Общая протяженность Гиссаро-Алая составляет около 800 км. Средняя высота хребтов 3—4 тыс. м, а отдельные вершины (Пирамидальная — Туркестанский хребет, Чимтарга — Зеравшанский хребет) превышают 5 тыс. м. Горные пики и самые высокие части водоразделов покрыты ледниками и вечными снегами.
На крайнем севере Таджикистана, на границе с Узбекистаном, в северо-восточном направлении простирается Кураминский хребет. Средняя его высота составляет 2—2,5 тыс. м. Вечные снега лежат только на самой высокой вершине хребта — горе Бобоиоб (3768 м). Юго-западная, сравнительно невысокая часть Кураминского хребта получила название Карамазар. На правом берегу р. Сырдарьи, к северу от Ленинабада, расположены невысокие горы Моголтау (до 1600 м), являющиеся продолжением Карамазара.
Сравнительно низкие горные хребты Юго-Западного Таджикистана— Джилантау, Сурхку, Сарсаряк и др. — находятся южнее Гиссарской долины и западнее Дарвазского хребта. Скучиваясь на северо-востоке, они веерообразно расходятся в юго-западном направлении и, постепенно снижаясь, переходят в равнину вблизи рек Пяндж и Амударьи. Средние высоты этих горных хребтов и гряд составляют 300—1700 м, наибольшие — до 2900 м.
Межгорные долины Таджикистана расположены на различной высоте над уровнем моря — от 300 до 2500 м. Наиболее крупные из них — Западно-Ферганская, Зеравшанская, Гиссарская, Вахшская, Нижнекафирниганская, Кулябская, Ванчская, Гунтская. В их пределах проживает большая часть населения республики. Многие долины чередуются с небольшими возвышенностями и увалами — адырами, которые широко используются под богарное земледелие и садоводство.
Климат Таджикистана разнообразен: субтропический — в низких долинах Таджикской депрессии, умеренно теплый — в средних ярусах гор и холодный — в их высоких частях. Таджикистан лежит вдали от открытых морей и океанов, внутри материка Евразии. Поэтому климат его является континентальным, характеризуется он резкими сезонными и суточными колебаниями температур.
Крупнейшие реки Таджикистана — Амударья, Сырдарья, Вахш, Пяндж и Зеравшан берут свое начало в горах и имеют ледниковое происхождение. Бурные в верховьях и средних течениях, они спокойно и величаво продолжают свой путь на равнинах. Реки Таджикистана имеют большое народнохозяйственное значение. Их воды дают жизнь долинным районам, ополяемым в летний зной ослепительно ярким солнцем. Имеющие исключительно крутое падение, реки Таджикистана таят огромные запасы гидроэнергии (11% гидроресурсов всей страны). На Вахше построена одна их крупных гидроэлектростанций нашей страны — Нурекская ГЭС. Ее плотина самая высокая в мире — более 300 м.
Озера расположены в основном на Памире и в горах Центрального Таджикистана. По происхождению котловин озера делятся на тектонические, ледниковые, завальные, карстовые и пойменные. Самое крупное ледниково-тектоническое озеро Каракуль (площадь 380 км2, максимальная глубина около 240 м) расположено в Восточном Памире на высоте 4 тыс. м. Озера Сарезское и Яшилькуль образовались в результате землетрясений и горных обвалов. Сарезское озеpo — одно из глубочайших в СССР. Его глубина превышает 500 м. В горах Зеравшанского хребта лежит тектоническое ледниково-завальное озеро Искандеркуль, привлекающее своей живописностью туристов. Животный мир рек и озер сравнительно беден. Некоторые виды рыб — сазан, лещ, сом, маринка, форель — имеют промысловое значение.
Высокие горы Таджикистана — крупнейший в СССР очаг современного оледенения. Общая площадь ледников достигает 9 тыс. км2, охватывая почти 6% территории республики. Самый большой ледник Таджикистана и всего Советского Союза — ледник Федченко, лежащий на Памире и протянувшийся на расстояние свыше 70 км. Ледники Таджикистана содержат огромные запасы воды, необходимой для питания рек.
Флора Таджикистана необыкновенно богата и разнообразна и насчитывает свыше 5 тыс. видов высших растений. В низинных равнинах преобладают полынные пустыни, а в поймах рек — тугаи из туранги, облепихи, зарослей камыша и эриаптусов. В горах находятся ореховые леса, арчевники, реже — степи, луга. На территории республики, в ее лесах и горных областях водится много зверей и птиц. Из хищников встречаются снежный барс, рысь, медведь, гиена, выдра, волк, лисица, куница. В тугаях Вахта и Нижнего Пянджа обитает тугайный олень, на Памире — архары. В тугаях нижнего течения Вахта создан государственный заповедник «Тигровая балка», где сохранились такие редкие животные, как бухарский олень-хангул, персидская выдра и др. На южном склоне Гиссарского хребта расположен заповедник «Ромит». В Таджикистане встречаются 81 вид млекопитающих, 365 видов птиц, 49 видов пресмыкающихся и 6—7 тыс. видов насекомых.