Натиски соседних государств и народов приводили к вынужденной миграции огромных групп ногаев на другие малообжитые территории. Отсутствие единства среди различных родов ногаев приводило к слабости по оказанию отпора беспокойных соседей. Вольные казаки, расположенные в пределах рек Хопёр и Медведица, воспользовавшись разобщённостью ногаев, стали захватывать земли Ногайской Орды, и вытеснять ногаев кочевавших между Волгой и Доном. Ногаи были оттеснены казаками в низовья Волги, ища спасения на восточном её берегу, но астраханский хан Ислам-Гирей (1531-1532 гг.) преградил им путь и не позволил переправу разобщённым ногайским ордам в пределы своих владений. Стиснутые с двух сторон, уступающие численно, ногаи были частично разбиты, оставшиеся двинулись в пределы Северного Кавказа, где и осели. Эта часть ногаев практически вышла из-под контроля биев Ногайской Орды и стали независимы от этого государства.
Не до конца доведенная система государственного устройства и расплывчатая структура государственного аппарата приводила к междоусобицам между потомками биев. В 1530-е годы в Ногайской Орде, между сыновьями бия Мусы шла династическая борьба, и уже не было самодержца. Практически было три Орды. Хотя Саид-Ахмад считал себя главою всех ногаев, нося титул бия в 1524-1541 годы, Шейх-Мамай носил титул кековат в 1537-1541 годы, и нурадином был в 1537-1541 годы Хаджи-Мухаммад.
Ещё один раскол элит Ногайской Орды был связан с торговыми отношениями. Часть ногайских мирз была заинтересована в переносе транзитного центра международной торговли из Средней Азии в Европу из Хаджи-Тархана в свою столицу – город Сарайчик. Определённая часть мирз Ногайской Орды, которая вела торговлю с Московским великим княжеством и Османской империей хотела захватить Хаджи-Тархан и сделать его своим торговым центом. Пришедший к власти в Ногайской Орде бий Шейх-Мамай (1541-1549 гг.) повёл политику на подрыв торговли Хаджи-Тархана. Снова раскол в элите Ногайской Орды, именно ориентированных на международную торговлю. Ставший в 1549 году бием Юсуф ибн Муса выбрал прокрымскую политику, в ущерб московской. Иную позицию занял его брат мирза Исмаил, торгующий с Москвой.
Противоречия между Юсуфом и Исмаилом способствовали тому, что сыновья прежнего бия Шейх-Мамая, племянники Юсуфа и Исмаила, стали проводить самостоятельную внешнюю и внутреннюю политику. Своё создаваемое государственное образование, которое пока не имело чётких границ, сыновья Шейх-Мамая назвали Алтыульским улусом. Первым правителем Алтыульской Орды стал в 1549 году Касим-бий, до этого кековат Ногайской Орды.
Поверив обещанию московского царя Ивана Васильевича, мирза Исмаил развязал братоубийственную междоусобицу против бия Юсуфа, закончившийся победой Исмаила.
Избранный в 1557 году бием Большой Ногайской Орды Исмаил ибн Муса, присягнул Русскому государству и признал себя вассалом русского царя. Из-за этого часть ногаев мигрирует на запад и под руководством Казы-мирзы (Гази ибн Урак) основывается на Кубани Малая Ногайская Орда. Ногаи Большие бия Исмаила сохранили территорию в Прикаспии от реки Волги до реки Яика.
Из-за суровой зимы 1557-1558 годов и голода погибло много ногаев на Нижней Волге. Ногайские улусы восставали, воевала между собой и часть ногаев откочевала на Приазовье.
В моих книгах:
«Старая Астрахань (XIII-XVI века)»
«Касимовское ханство (XV-XVII века)» написана история Ногайской Орды.