С распадом Советского Союза, Китай выдвинул целый ряд территориальных претензий центральноазиатским государствам.
У Таджикистана из-за гражданской войны решение погранично-территориальных проблем с Китаем оказалось долгим. Только в 1999 году между двумя странами было подписано соглашение «О таджикско-китайской госгранице», где Таджикистан уступил КНР 200 кв.км. территории у реки Маркансу, но сохранил территорию перевала Карзак.
В мае 2002 было подписано дополнительное соглашение «О демаркации границы и урегулировании территориальных споров», согласно которому Таджикистан согласился передать Китаю более 1 тысяч кв.км спорных территорий в ГБАО, по мнению таджикских экспертов – это две территории города Душанбе.